Si deseas hacer un backup de tus cuentas de e-mail, mensajes y configuraciones de correo de la aplicación mail.app es necesario copiar todos los elementos contenidos en
/Volumes/Macintosh HD/Users/NOMBRE_USUARIO/Library/Mail/V2
Para respaldar puedes usar terminal y usar el siguiente comando
cp -r -v /Volumes/Macintosh HD/Users/NOMBRE_USUARIO/Library/Mail/ /Volumenes/unidad_extraible
Y para cargar la configuración, siempre desde terminal, posicionandote en tu unidad extraible
cp -r -v /Volumenes/unidad_extraible/V2/ /Users/NOMBRE_USUARIO/Library/Mail/V2
Y listo…. Todas tus cuentas de e-mail estarán listas para usar